El principal problema es la procreación de hijos con problemas físicos debido a la genética similar de los padres.
En la antigüedad, esta práctica fue común en distintas culturas, sin embargo el resultado fue de hijos con problemas físicos y mentales evidentes.
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Se pensaba que casándose entre parientes cercanos se mantendría el linaje real puro, hoy día se sabe que esta práctica provocaba serias deficiencias en el producto de dichas uniones.
Inconvenientes de casarse con parientes:
• La negativa legal por querer casarse con un pariente cercano, los registros civiles en su gran mayoría no registran como uniones legales a hermanos, primos, tíos, y hasta padres.
• La mayor parte de religiones consideran la unión entre parientes cercanos como impuras y condenables, por lo que es prohibida.
La lógica indica como un fenómeno anti natural el hecho de unirse con un pariente cercano, por las implicaciones legales y religiosas antes mencionadas.